Program Studi Fisika di Universitas Mulawarman merupakan salah satu Program Studi S1 (Sarjana) pada Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam. Berdasarkan Surat Keputusan Direktorat Jendral Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan Nasional nomor 2811/D/1/2001, Program Studi Fisika berdiri tanggal 30 Agustus 2001 bersamaan dengan berdirinya unit pelaksana FMIPA (Up. FMIPA) dengan jenjang pendidikan sarjana (S1) dan mulai menerima mahasiswa pada Tahun Akademik 2001/2002.
Pada tahun 2006 Up. FMIPA memperoleh peningkatan status menjadi FMIPA berdasarkan Surat Keputusan Dirjen Dikit Nomor 1344/D/I/2006 tanggal 3 Mei 2006. Peningkatan status ini memperkuat status Program Studi Fisika yang berada dibawah FMIPA dan mendukung PS Fisika untuk lebih berkembang. Selanjutnya pada tahun 2008 PS Fisika resmi terakreditasi berdasarkan Keputusan BAN-PT no. 012/BAN-PT/Ak-XI/S1/VI/2008 tanggal 28 Juni 2008.